Estudiantes
Información General
Este espacio está destinado a servir como punto de información, de actividades, noticias o recomendaciones,
para todos los usuarios y usuarias del CBIB.
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Lineas de Investigacion
del CBIB
El CBIB en la actualidad maneja 3 grandes
líneas de investigación, de las cuales se derivan proyectos desarrollados
por miembros del grupo, estudiantes de maestria y pregrado.
Biodiversidad
y Bioinformática
El objetivo de esta línea de trabajo,
es contribuir al conocimiento de la biodiversidad colombiana a través
del desarrollo e implementación de un sistema bioinformático que
permita el almacenamiento, recuperación y análisis de datos moleculares,
a partir de los cuales se desarrollen modelos de análisis filogenéticos
que integren comprensivamente datos morfológicos, fisiológicos,
bioquímicos y moleculares.
Dentro del marco de esta línea de
investigación, se han generado diversos proyectos:
- Aproximación Filogenética
Molecular para Probar una Hipótesis de Distribución de Anfibios
en los Andes Colombianos. (Sonia Mahecha Vahos, John Lynch, Emiliano
Barreto, Ramón Mantilla). Abstract
La Bioinformática
en la Salud
El objetivo de esta línea de trabajo
es contribuir a la obtención, almacenamiento y análisis de datos producto
de estudios moleculares, para la clasificación y aprovechamiento de información
biológica relacionada con el área de la salud.
Dentro del marco de esta línea de
investigación, se han generado diversos proyectos:
- Uso de herramientas bioinformáticas combinado
con estudios moleculares para identificar redes de genes expresados en islotes
pancreáticos durante el desarrollo de diabetes tipo I. (Gina
Gutiérrez, Camila Manrique, Jaime Peña, Nikolai Petrovsky, Diego G
Silva, Emiliano Barreto Hernández) Abstract
Desarrollo de herramientas
Bioinformáticas
El objetivo de esta línea de trabajo
es desarrollar herramientas de computo orientadas al modelamiento y biúsqueda de informacíon a partir de datos moleculares de gran escala.
- Sequence Retrieve System
federation Server - IBUN_UNAL
SRS Federation es un trabajo en progreso.
Consiste en utilizar un grupo disperso de servidores de SRS que actua de manera concertada para proveer a los usuarios una fuente de alta calidad y disponibilidad de datos biológicos, moleculares, entre otros. El proyecto se adelanta con base en el trabajo voluntario de los miembros de la EMBnet (inicialmente Suecia, Eslovaquia y Belgica, a la que se unieron mas adelante Brasil, Colombia y Polonia) con la ayuda activa de LION Bioscience.
- Identificación de sitios de unión de proteínas por métodos de aprendizaje de máquina.
(Bobadilla Leonardo, Niño Luis Fernando, Gonzalez Fabio, Barreto Emiliano)
Con este proyecto se pretende desarrollar un modelo computacional para localizar sitios funcionales a partir de la estructura tridimensional de una proteína. Esta iniciativa se adelanta en conjunto con el Laboratorio de Sistemas Inteligentes de la Facultad de Ingeniería de la Universidad Nacional de Colombia- Sede Bogotá.
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