Tema

Detalles

S1: Introducción

Generalidades e historia de la bioinformática, línea de tiempo. Nuestra bioinformática.

S1: Bases de datos Biologica I

Bases de datos relacionales. Bases de datos primarias más relevantes, Genbank/EMBL/DDBJ, Swissprot, PDB. Formatos de salida. .

S2: Bases de datos Biologicas: Presentaciones

Presentan estudiantes. Introducción a las bases de datos secundarias más relevantes. Se explica la teoría biológica alrededor de ellas (perfiles, patrones etc.)

S2: Bases de datos Biologicas: Presentaciones

Presentan estudiantes. Introducción a las bases de datos secundarias más relevantes. Se explica la teoría biológica alrededor de ellas (perfiles, patrones etc.)

S3: Práctica

S3: Alineamiento de secuencias

Alineamiento ( local, global). Matrices de sustitución, herramientas.

S4: DOTPLOT, Pareado,

S4: Alineamiento multiple

S5: Multiple

S5: BLAST

E-values, bitscore, estadísticas detrás de BLAST. Sabores de BLAST (PSI-BLAST-PHI-BLAST)

S6: BLAST

S6: DISEÑO PRIMERS, Practica

S7: PARCIAL 1

S7: Avance proyectos

S8: Avance proyectos

S8: Suites para análisis de secuencias

Ambientes para análisis. EMBOSS, GALAXY, CLC-Geneious-bioEdit .

S9: EMBOSS

S9: Programación: Análisis masivo de datosIntro a la programación, Tutorial Linux

Introducción a UNIX. Lenguajes compilados, interpretados...

S10: Seminarios

S11: Ensamblaje de novo de genomas

Introducción a la genómica.

S11: NGS de Novo

S12: Ensamblaje por mapeo de genomas

Introducción a la genómica.

S12: NGS Mapping

S13:Filogenia molecular

Introducción, reloj molecular, nomenclatura de árboles.

S13:

MEGA

S14:Biología estructural

Análisis estrutural y funcional de proteínas

S14:

S15: Parcial 2

S15 -S16: Presentación final de proyectos