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Introducción a la Bioinformática

BIOINFORMÁTICA



Código:   2018947-1
Modalidad: Teórico-Práctica
Intensidad: 4   horas semanales
Cupo:         15 estudiantes
 
 

Programa

Documento sin título

Tema

Detalles

S1: Introducción

Generalidades e historia de la bioinformática, línea de tiempo. Nuestra bioinformática.

S2: Bases de datos Biologica I

Bases de datos relacionales. Bases de datos primarias más relevantes, Genbank/EMBL/DDBJ, Swissprot, PDB. Formatos de salida. .

S2: Práctica


S3: Bases de datos Biologica II

Presentan estudiantes. Introducción a las bases de datos secundarias más relevantes. Se explica la teoría biológica alrededor de ellas (perfiles, patrones etc.)

S3: Práctica1 Práctica2

 

S4: Alineamiento de secuencias

Alineamiento ( local, global). Matrices de sustitución, herramientas.

S4: DOTPLOT, Pareado, Multiple


S5: FASTA, BLAST, Alineamiento multiple

E-values, bitscore, estadísticas detrás de BLAST. Sabores de BLAST (PSI-BLAST-PHI-BLAST)

S5: BLAST


S6: PARCIAL 1

S6: Avance proyectos

S7: Suites para análisis de secuencias

Ambientes para análisis. EMBOSS, GALAXY, CLC-Geneious-bioEdit .

S7: EMBOSS, S7: DISEÑO PRIMERS


S8:Expresión diferencial de genes

Qué es el análisis de expresión diferencial, para que sirve? SAGE, Microarreglos. Protocolo de análisis.

S8:


S9: Programación: Análisis masivo de datosIntro a la programación

Introducción a UNIX. Lenguajes compilados, interpretados...

S9:


S10: Seminarios

S11: Ensamblaje anotación y comparación de genomasGenómica

Introducción a la genómica, Genómica comparativa, genómica funcional. Anotación de genomas.

S11: NGS Mapping y NGS de Novo


S12:Filogenia molecular

Introducción, reloj molecular, nomenclatura de árboles.

S12:

CLC, clustal

S13: Filogenia molecular

Introducción, reloj molecular, nomenclatura de árboles.

S13:

CLC, clustal

S14:Biología estructural

Análisis estrutural y funcional de proteínas

S14:

 

S15: Parcial 2

S15 -S16: Presentación final de proyectos

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