.:: Centro de Bioinformática del Instituto de Biotecnología ::.
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Herramientas
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Herramientas ofrecidas por el C.B.I.B. Emboss
Esta es la "Suite de Código Abierto del Instituto Europeo de Biología Molecular". Un completo paquete de herramientas para análisis moleculares. Cuenta con más de cien herramientas, que van desde el alineamiento de secuencias e identificación de motivos en proteínas, hasta utilidades para la presentación de publicaciónes.Si lo desea puede iniciar una sesión con EMBOSS ahora mismo, o si desea mayor información puede consultar la documentación. Blast
Uno de los objetivos primordiales del CBIB es mantener al
alcance de todos las bases de datos y herramientas de mayor uso en bioinformática, por
esta razón mantenemos espejos (copias exactas) locales de las más importantes
bases de datos moleculares a nivel mundial, así como de sus
herramientas asociadas.BLAST es el acrónimo para Basic Local Alignment Search Tool, una herramienta basada en uno de los algoritmos más eficientes para el alineamiento local de secuencias. Realizar una búsqueda BLAST Blee
EL CBIB se dio a la tarea de ordenar y sistematizar la informacion de un
grupo de enzimas de alta relevancia en la clinica y epidemiología,
como lo son las Betalactamasas de Espectro Extendido (BLEE).Esta sencilla herramienta on-line le permitirá identificar de una manera sistematica la(s) BLEE(s) de su interes. Realizar una búsqueda de BLEE SMS
SMS es el acrónimo para Sequence Manipulation Suite. Esta suite
consta de una serie de herramientas para el análisis y edición de
secuencias de DNA y proteínas. En principio algunas de sus
herramientas son similares a las del paquete EMBOSS. Utilizar SMS.
Sewer
SEquence analysis using WEb Resources. Es un programa desarrollado en
JavaScript, que permite realizar analisis moleculares utilizando
diversos recursos web gratuitos.
En síntesis SEWER es una interface común a muchos recursos web en bioinformática. Desde esta interface puede realizar, por ejemplo, análisis de proteínas o DNA en diferentes servidores alrededor del mundo, como el NCBI o EMBL. Utilizar SEWER Dotlet
Esta herramienta le permite realizar gráficos de dotplot de manera
similar a como lo hace la herramienta dotmatcher en el paquete de análisis EMBOSS.
Sin embargo Dotlet es mucho más flexible y permite diversas
modificaciones en tiempo real, que le permiten analizar y evaluar sus
alineamientos de una manera más efectiva. Esta herramienta requiere
que su sistema cuente con una máquiana virtual de java operativa. Trabajar con Dotlet!
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