EMBOSS es un conjunto de software  de carácter gratuito y de fuente abierta,  para el análisis de secuencias de acidos nucleicos y/o proteínas especialmente desarrollado para las necesidades de la comunidad de biologos moleculares. EMBOSS contiene un núcleo de grupos de programas licenciados bajo el GPL,  esto quiere decir que puede ser legalmente copiado o modificado según las necesidades del usuario.  El software automáticamente trabaja con datos en una variedad de formatos e incluso permite obtener  secuencias publicadas en  la web. Es una plataforma que permite a los científicos el desarrollo y realización de software personales,  gracias a su carácter de fuente abierta.

Los  programas  de EMBOSS trabajan bajo las mismas librerías (AJAX y NUCLEUS) y ha sido desarrollado principalmente por los creadores del ahora difunto EGCG. Muchos otros programas (EMBASSY) incluyendo PHYLIP y MSE, han sido incorporados dentro de EMBOSS para usar la misma interfaz pero son distribuidos bajo su propia licencia. EMBOSS y  el nodo EMBnet son actualizados diariamente, así que siempre se tiene la última versión de los programas.

En el presente se puede acceder a EMBOSS bajando la aplicación   y trabajando por  línea de comandos o vía web por medio de PISE WWW  , pero las interfaces gráficas están aún bajo construcción, así que algunos programas no se encuentran. Para obtener una descripción de los programas de Pise y poder acceder a estos, visite http://www2.no.embnet.org/Pise/index.php3

Para aprender a manejar algunos programas de EMBOSS puede  aprender por medio del tutorial
 

EMBOSS es soportado todos las plataformas comunes de Unix incluyendo Linux, Digital Unix, Irix and Solaris

En EMBOSS se encuentran alrededor de 100programas (aplicaciones).

Estas son algunas areas que cubre:

Alineamiento de secuencias
Búsqueda rápida de patrones de secuencias.
Identificación de motivos de proteínas, incluyendo anàlisis de dominios.
Análisis de  EST
Análisis de patrones de secuencias nucleótidos.
Uso de codones para análisis de pequeños genomas.
Rápida identificación de patrones de secuencias para grupos de secuencias a gran escala.
Herramientas de presentación  para publicación.
Y mucho más.
 
 
 

Links

The EMBOSS Administrators Guide
Para obtener información acerca de la instalación de EMBOSS.

EMBOSS homepage
 

The EMBOSS package
Página de Introducción de EMBOSS del EMBnet.
 

BioBox
Información sobre las diferentes suites existentes.