ID   AMINOPEP_AD_CTER; MATRIX.
AC   PS50611;
DT   Tue Jul 15 09:57:54 2003
DE   Generated from MSF file: 'walinea56.1.msa'.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76;
CC   Automatic scaling using shuffled database
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8257; R2=0.01619320; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=412; N_SCORE=8.5; MODE=1;
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=288; N_SCORE=6.5; MODE=1;
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-31,-39,-32,-26,25,-25,-9,-10,-17,-9,-10,-30,-30,-18,-16,-30,-20,-19,87,50,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-23,7,14,-22,-14,-2,-19,6,-18,-12,17,-13,8,2,4,1,-21,-31,-15,11;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-15,-27,-15,-4,-13,-23,-7,-14,12,1,0,-9,-22,3,34,-16,-10,-11,-20,-7,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-23,49,-29,1,-2,-16,3,-1,-19,-29,-22,-9,-19,-10,-6,18,52,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-25,-11,-1,-18,-23,-9,-12,14,-7,-1,-9,-18,7,18,-10,-5,-7,-22,-8,2;
MA   /M: SY='K'; M=4,4,-23,-1,1,-26,-5,-7,-23,11,-22,-12,7,-13,5,8,2,-4,-18,-24,-16,3;
MA   /M: SY='S'; M=4,2,-17,2,15,-21,-11,-2,-21,-4,-20,-16,3,-8,4,-7,18,13,-14,-33,-15,9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,24,-18,14,0,-20,-7,-1,-20,-2,-25,-18,33,-16,-2,0,13,13,-20,-36,-17,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-8,-16,-5,-15,-6,-23,-19,8,-16,2,-1,-12,-24,-20,-16,-7,-3,19,-30,-10,-17;
MA   /M: SY='A'; M=22,-8,-19,-13,-6,-19,-4,-2,-16,-6,-15,-9,-6,-8,-2,-12,4,-5,-11,-19,-9,-5;
MA   /M: SY='S'; M=7,1,-17,-2,5,-22,0,-11,-21,-7,-21,-16,5,-10,1,-9,18,11,-14,-31,-19,3;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-30,23,58,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,1,-1,19,-1,0,-10,-30,-31,-20,38;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-30,0,15,-28,-20,-5,-29,38,-26,-11,0,-11,14,34,-8,-10,-22,-21,-11,13;
MA   /M: SY='T'; M=-7,0,-22,1,3,-17,-19,-11,-9,-6,-8,-8,-3,-14,0,-5,3,5,-6,-29,-12,0;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-14,-25,-16,-5,-9,-24,-13,1,-1,2,4,-11,-17,-4,0,-11,-5,-1,-20,-3,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-34,-24,6,-33,-23,32,-29,37,22,-26,-26,-19,-23,-26,-10,18,-20,0,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-21,-26,-16,1,-26,-14,16,-22,30,22,-22,-24,-9,-16,-19,-7,7,-22,-2,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-9,4,-23,-1,-3,-16,-10,-1,-20,6,-20,-12,11,-18,2,14,4,2,-16,-24,-6,-2;
MA   /M: SY='A'; M=22,-6,-7,-11,-8,-20,3,-17,-17,-12,-19,-15,-1,-12,-8,-16,20,11,-7,-29,-20,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-31,-21,14,-29,-18,19,-28,44,22,-28,-29,-20,-19,-28,-10,9,-18,2,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=13,-8,-22,-11,-14,-25,40,-19,-29,-16,-25,-17,-1,-16,-14,-18,9,-7,-19,-23,-25,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-17,91,-26,-26,-21,-20,-27,-28,-26,-20,-19,-16,-34,-26,-27,-4,-7,-10,-45,-28,-26;
MA   /M: SY='T'; M=2,-11,-7,-15,-13,-11,-18,-19,-3,-14,-11,-8,-7,-11,-13,-15,12,18,5,-30,-11,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-25,-4,5,-25,-9,-7,-26,15,-24,-12,1,-9,10,20,3,-1,-20,-25,-15,6;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-25,12,15,-23,-16,9,-18,0,-19,-12,13,-13,6,-3,0,-4,-18,-32,-12,10;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-13,-23,-13,-6,-17,-19,-13,-5,-9,-12,-6,-11,10,-2,-12,-2,-1,-5,-25,-12,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-20,-34,-21,-13,-3,-17,-18,-20,-5,-19,-15,-19,-15,-8,-5,-16,-15,-21,48,6,-9;
MA   /M: SY='L'; M=3,-20,-19,-23,-16,-3,-22,-18,10,-18,15,6,-17,-21,-14,-17,-9,-2,7,-20,-3,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-31,-22,5,-26,-20,22,-27,36,21,-26,-27,-19,-21,-25,-10,13,-20,-2,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,2,-26,4,15,-22,-17,0,-22,5,-17,-10,-1,-11,20,7,0,-4,-21,-21,-8,17;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-28,-3,3,-23,-18,1,-28,27,-22,-10,1,-16,7,41,-7,-7,-19,-22,-9,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-26,-22,-28,-24,29,-30,-5,10,-20,14,6,-24,-30,-21,-16,-20,-8,8,4,37,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-32,-22,13,-31,-21,24,-29,41,20,-27,-28,-21,-21,-27,-10,13,-18,2,-22;
MA   /M: SY='B'; M=-9,21,-26,21,15,-29,-12,1,-24,5,-24,-16,18,-12,12,1,3,-6,-24,-32,-17,13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-15,-27,-16,-11,0,-21,-12,-5,-11,2,0,-13,-21,-5,-5,-16,-11,-10,10,3,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=17,-9,-15,-17,-12,-14,-7,-17,-3,-13,-8,-2,-5,-13,-9,-16,9,8,1,-26,-14,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-28,-25,-34,-26,15,-28,-20,18,-23,12,16,-23,-24,-20,-20,-19,-10,12,4,7,-22;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-13,1,-1,-10,-9,-3,-10,-7,-9,-8,4,-12,-3,-8,8,7,-8,-21,-5,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-23,19,8,-25,1,-6,-25,-4,-23,-18,6,7,-2,-9,3,-6,-22,-26,-19,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-9,16,-23,16,19,-25,-13,-2,-24,5,-22,-16,13,-10,8,1,7,2,-22,-32,-17,13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-3,12,-19,13,5,-18,-5,3,-22,-5,-23,-17,12,-12,0,-8,13,2,-18,-28,-8,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-21,-7,-6,-14,2,-12,-9,-5,-10,-6,-3,-14,-8,-9,-4,-6,-7,-17,-9,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,-20,-29,-26,-1,-31,-23,30,-18,10,13,-20,-25,-21,-19,-13,-5,31,-23,-2,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-14,-28,-14,-5,-9,-19,-6,-22,17,-14,-8,-6,-16,0,45,-12,-10,-14,-18,-7,-6;
MA   /M: SY='K'; M=0,-5,-25,-8,-1,-23,-13,-13,-19,14,-21,-11,-1,-2,-1,9,-1,-2,-14,-24,-15,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,4,-30,6,18,-38,-19,14,-23,9,-21,-3,3,-11,49,10,-1,-11,-30,-23,-9,33;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-28,59,19,-36,-10,0,-36,0,-29,-28,22,-10,0,-9,2,-6,-29,-39,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-8,-22,-9,-7,-10,-13,-4,-13,0,-12,-5,-6,-18,-2,4,0,-3,-9,-15,4,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-16,-16,-21,-15,12,-23,-19,2,-16,2,0,-12,-20,-18,-13,-1,9,7,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-19,-12,-10,-4,-16,-12,-10,-7,-8,-8,1,-18,-8,1,4,8,-7,-20,-7,-9;
MA   /M: SY='V'; M=9,-21,9,-26,-22,-8,-21,-25,6,-20,4,0,-20,-25,-21,-21,-5,-1,17,-30,-14,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-38,-29,50,-32,-22,14,-29,18,7,-22,-28,-33,-22,-21,-9,10,-2,18,-29;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-10,-20,-13,-6,-13,-13,-12,-6,-7,-11,-4,-5,-16,3,-6,6,2,-4,-25,-10,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=21,-14,-16,-20,-14,-3,-6,-11,-6,-12,-7,-4,-12,-17,-12,-17,2,-2,-1,-11,3,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-17,-32,-28,7,-32,-26,30,-23,16,12,-27,-28,-26,-22,-16,-4,35,-21,0,-28;
MA   /M: SY='A'; M=22,-9,-13,-14,-6,-18,-6,-13,-10,-8,-12,-6,-5,-13,-2,-10,13,4,-3,-27,-16,-5;
MA   /M: SY='G'; M=2,-3,-22,-6,-8,-19,6,-13,-18,-9,-18,-12,2,-16,-6,-6,5,-1,-13,-25,-16,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-7,26,-20,12,-2,-20,1,9,-21,-3,-28,-18,42,-18,-1,-1,12,3,-25,-37,-18,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-29,-4,6,-23,-18,-14,-16,-4,-19,-14,-11,29,-4,-7,-3,-6,-16,-30,-21,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-14,-19,-14,-7,-10,-23,-18,6,-9,3,3,-15,-19,-11,-12,-8,-4,11,-26,-10,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-28,-5,-16,-28,57,-15,-36,-16,-30,-20,11,-20,-16,-16,2,-16,-30,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-12,-25,-13,0,5,-23,2,-10,-6,-2,-3,-10,-19,1,-1,-10,-6,-13,-8,14,0;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-25,2,4,-18,-15,-7,-16,-4,-13,-11,-1,2,-1,-6,-1,-4,-17,-27,-12,0;
MA   /M: SY='I'; M=0,-24,-19,-31,-22,4,-26,-21,21,-22,19,17,-21,-22,-17,-21,-15,-4,17,-20,-3,-21;
MA   /M: SY='A'; M=28,-17,-13,-22,-17,-14,-2,-23,-1,-15,-3,-4,-15,-18,-17,-20,1,-3,11,-23,-17,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-24,-31,-26,-16,11,-24,-19,-10,-3,-2,-2,-22,-24,-14,-5,-25,-16,-12,34,11,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-13,24,-28,26,20,-32,-13,2,-29,13,-27,-18,19,-11,13,5,0,-8,-28,-32,-17,17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-24,-25,-30,-24,54,-30,2,-1,-21,4,0,-19,-30,-25,-15,-20,-10,-6,17,51,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-19,-32,-24,23,-30,-19,18,-26,29,15,-26,-29,-24,-20,-23,-8,15,-13,9,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-21,-14,-5,-15,-23,-6,-11,12,-10,1,-8,-19,5,22,-10,-8,-8,-19,-3,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,25,-26,28,27,-28,-9,1,-28,3,-24,-21,20,-10,6,-4,2,-7,-27,-35,-20,17;
MA   /M: SY='N'; M=-11,32,-22,16,1,-21,-4,18,-21,1,-28,-17,49,-19,5,4,7,-3,-30,-37,-15,2;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-25,-30,-29,-23,5,-20,-23,-1,-18,-9,-6,-21,-25,-18,-18,-16,-12,-3,46,8,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-5,16,-27,22,17,-34,-14,-3,-29,14,-24,-16,5,-9,15,3,-1,-9,-24,-28,-16,16;
MA   /M: SY='E'; M=7,0,-21,-2,8,-19,-13,-9,-17,4,-15,-11,-2,-12,3,-1,1,-5,-12,-24,-14,6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-37,-28,2,-36,-26,42,-28,25,22,-22,-22,-19,-26,-21,-9,27,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-25,-13,-8,-9,-23,-4,-7,6,-6,-1,-6,-21,-4,12,-11,-7,-4,-18,2,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,11,-25,10,22,-26,-15,-3,-26,18,-25,-16,13,-9,9,8,3,-1,-23,-29,-16,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-25,-21,-16,19,-27,1,-2,-11,5,1,-16,-26,-9,-4,-15,-3,-7,4,36,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /GENERATED_BY="pfmake -2bm walinea56.1.msa /usr/molbio/share/pftools/blosum45.cmp";
//