ID RVTAD2; MATRIX. AC PS50621; DT Wed Jul 30 13:59:01 2003 DE Generated from MSF file: 'walinea229.1.msa'. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51; CC Automatic scaling using shuffled database MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9709; R2=0.01233079; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=529; N_SCORE=8.5; MODE=1; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=367; N_SCORE=6.5; MODE=1; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,32,-6,-36,-16,-4; MA /M: SY='E'; M=-12,18,-30,30,52,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34; MA /M: SY='R'; M=-16,-10,-30,-11,1,-22,-22,-1,-18,18,-15,-4,-2,-18,18,44,-9,-10,-16,-20,-9,6; MA /M: SY='A'; M=37,-15,-10,-23,-15,-15,-8,-23,0,-13,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,13,-23,-17,-15; MA /M: SY='T'; M=-3,-9,-13,-12,-15,-9,-23,-21,2,-10,-4,-4,-10,-19,-15,-7,4,20,16,-30,-11,-16; MA /M: SY='T'; M=1,0,-13,-5,-5,-15,-12,-1,-16,-10,-19,-13,5,-11,-4,-9,24,30,-8,-34,-10,-5; MA /M: SY='H'; M=8,-2,-22,-1,-1,-24,-10,16,-21,-9,-21,-12,0,4,-2,-12,5,-5,-17,-29,-11,-4; MA /M: SY='E'; M=2,4,-24,8,25,-26,-15,-8,-20,6,-18,-15,-1,-6,7,-4,4,-5,-17,-28,-17,15; MA /M: SY='D'; M=-8,13,-24,19,5,-29,1,-6,-30,-1,-26,-19,8,-13,4,0,9,0,-22,-31,-18,4; MA /M: SY='L'; M=-11,-27,-23,-31,-21,4,-30,-17,24,-23,34,26,-24,-25,-15,-16,-25,-10,13,-20,-1,-19; MA /M: SY='V'; M=-5,-23,-19,-25,-17,-6,-29,-20,23,-15,8,16,-21,-22,-11,-16,-12,-5,26,-26,-7,-15; MA /M: SY='E'; M=-12,0,-28,4,21,-22,-22,-7,-16,10,-14,-10,-3,-11,6,12,-6,-9,-13,-27,-14,12; MA /M: SY='A'; M=19,-17,-16,-25,-17,-11,-15,-20,11,-16,0,5,-13,-15,-12,-20,1,-1,12,-23,-12,-16; MA /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-13,20,-23,39,35,-26,-26,-13,-16,-26,-10,10,-20,0,-16; MA /M: SY='T'; M=-2,-9,-13,-11,-14,-8,-22,-21,2,-15,0,-3,-10,-18,-15,-14,5,21,13,-31,-11,-15; MA /M: SY='R'; M=-6,4,-25,5,7,-24,-16,-7,-26,17,-21,-14,2,-12,4,22,-1,0,-17,-25,-13,4; MA /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-19,-10,-19,-1,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,4,0,-21,-19,-10; MA /M: SY='C'; M=-8,-18,107,-27,-27,-20,-27,-28,-29,-28,-21,-20,-17,-37,-27,-28,-5,-7,-10,-49,-29,-27; MA /M: SY='D'; M=-17,45,-27,59,16,-36,-8,1,-36,-1,-30,-28,25,-11,0,-9,4,-7,-29,-40,-20,8; MA /M: SY='E'; M=8,-5,-23,-4,14,-23,-8,-13,-15,0,-14,-11,-7,-10,0,-8,-1,-7,-10,-24,-18,6; MA /M: SY='T'; M=13,-7,-10,-16,-13,-11,-16,-22,-4,-12,-7,-7,-7,-13,-13,-14,13,29,8,-27,-13,-13; MA /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10; MA /M: SY='Q'; M=1,-4,-22,-4,8,-26,-14,-6,-15,-3,-20,-10,-1,0,18,-6,11,3,-16,-28,-16,12; MA /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1; MA /M: SY='V'; M=2,-22,-17,-24,-19,-7,-24,-21,10,-8,3,4,-19,-24,-16,0,-9,-4,22,-25,-10,-19; MA /M: SY='F'; M=-9,-7,-22,-12,-7,6,-18,-13,-16,3,-16,-10,0,-10,-10,-1,-1,2,-12,-18,-2,-7; MA /M: SY='P'; M=-9,-7,-29,-5,-2,-24,-11,-3,-23,0,-26,-15,-2,25,-3,0,-1,-2,-23,-29,-18,-6; MA /M: SY='T'; M=-1,-11,-17,-12,-10,-7,-16,-12,-6,-14,-8,-7,-8,-7,-9,-13,9,12,-3,-24,-2,-11; MA /M: SY='Q'; M=-8,1,-12,-4,0,-21,-18,12,-17,-6,-15,-6,5,-16,13,-4,4,5,-18,-30,-7,6; MA /I: I=-5; MD=-25; MA /M: SY='D'; M=-5,7,-21,13,3,-25,6,-7,-24,-2,-23,-16,5,-2,1,-6,6,-4,-19,-25,-17,1; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-25; MA /M: SY='H'; M=-6,6,-20,5,-1,-14,-11,36,-19,-6,-16,-7,9,-14,2,-5,-1,-8,-18,-21,6,-2; D=-5; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='P'; M=-7,-9,-27,-9,-2,-22,-19,-14,-19,-2,-22,-14,-7,27,-1,1,3,10,-18,-28,-18,-4; MA /M: SY='H'; M=-12,-3,-30,-6,-9,-17,8,19,-28,-3,-23,-12,6,-21,-4,2,-7,-15,-26,-9,1,-8; MA /M: SY='R'; M=-17,-8,-31,-8,3,-24,-20,5,-28,23,-22,-9,-1,-9,13,49,-9,-11,-22,-21,-10,4; MA /M: SY='P'; M=-10,8,-31,18,7,-33,-8,-10,-28,-6,-29,-22,0,28,0,-13,1,-7,-27,-33,-24,1; MA /M: SY='V'; M=18,-21,-13,-26,-19,-6,-17,-22,11,-17,10,7,-21,-21,-18,-19,-6,-3,19,-23,-12,-18; MA /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,11,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22; MA /M: SY='W'; M=-17,-37,-47,-37,-27,7,-18,-28,-20,-19,-21,-20,-36,-28,-18,-19,-33,-26,-28,134,26,-18; MA /M: SY='W'; M=-20,-39,-42,-40,-30,9,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-29,141,27,-20; MA /M: SY='T'; M=3,3,-11,-7,-8,-13,-15,-16,-12,-9,-14,-12,6,-11,-8,-10,20,39,-4,-31,-13,-8; MA /M: SY='P'; M=-2,-17,-33,-11,-1,-26,-17,-17,-16,-10,-22,-15,-16,58,-6,-17,-5,-7,-23,-28,-25,-7; MA /M: SY='A'; M=15,-8,-17,-8,8,-17,-13,-14,-8,-7,-6,-8,-10,-12,-4,-13,3,-2,-2,-26,-17,2; MA /M: SY='I'; M=-11,-28,-28,-36,-26,0,-36,-26,38,-25,22,18,-20,-22,-18,-20,-21,-10,22,-20,-1,-26; MA /M: SY='E'; M=-2,2,-27,5,31,-28,-17,-4,-26,16,-20,-14,-2,-6,17,10,-1,-8,-23,-25,-16,23; MA /M: SY='E'; M=3,-7,-23,-7,4,-18,-18,-11,-8,-3,-5,-5,-8,-14,1,0,-5,-7,-5,-24,-13,2; MA /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-27,-16,4,-28,-15,16,-24,40,22,-26,-27,-10,-16,-26,-10,6,-20,-1,-13; MA /M: SY='R'; M=-16,-13,-18,-14,-4,-17,-23,-7,-18,15,-14,-7,-5,-21,2,43,-11,-9,-10,-23,-11,-5; MA /M: SY='E'; M=-6,15,-26,16,17,-28,-5,-3,-29,7,-24,-19,13,-11,4,6,1,-8,-25,-30,-19,10; MA /M: SY='E'; M=-11,14,-26,13,23,-22,-16,-2,-17,3,-15,-13,14,-11,6,-3,-2,-7,-21,-31,-16,14; MA /M: SY='C'; M=-8,-18,110,-28,-28,-20,-28,-28,-29,-28,-21,-20,-18,-38,-28,-28,-6,-8,-10,-49,-29,-28; MA /M: SY='R'; M=-11,-11,-26,-9,-4,-14,-24,-14,-5,5,-1,-1,-12,-14,-6,6,-14,-9,-2,-24,-9,-6; MA /M: SY='A'; M=16,-12,-19,-16,-4,-15,-14,-6,-7,-8,-2,-3,-10,-15,-5,-6,-3,-6,-4,-22,-11,-6; MA /M: SY='A'; M=41,-7,-13,-15,-8,-21,-2,-17,-13,-6,-12,-11,-8,-11,-8,-12,8,-1,-3,-21,-19,-8; MA /M: SY='R'; M=-13,-1,-26,2,8,-23,-16,-3,-29,20,-24,-14,3,-15,8,39,1,-5,-20,-26,-14,5; MA /M: SY='E'; M=-14,17,-30,27,36,-33,-17,2,-31,9,-23,-18,6,-7,20,6,-1,-10,-29,-30,-17,27; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; CC /GENERATED_BY="pfmake -2bm walinea229.1.msa /usr/molbio/share/pftools/blosum45.cmp"; //