ID   RVTAD1; MATRIX.
AC   PS50620;
DT   Tue Jul 29 13:30:49 2003
DE   Generated from MSF file: 'walinea202.1.msa'.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
CC   Automatic scaling using shuffled database
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6509; R2=0.01185915; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=577; N_SCORE=8.5; MODE=1;
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=408; N_SCORE=6.5; MODE=1;
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-10,-15,-10,-15,-9,-20,-10,-10,-10,-10,-5,-10,-10,-15,15,23,0,-25,-15,-10;
MA   /M: SY='P'; M=0,-10,-26,-6,-3,-26,3,-16,-23,-12,-30,-20,-4,30,-7,-16,13,1,-22,-33,-26,-7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-18,-35,-10,-1,-28,-17,-19,-19,-10,-28,-19,-17,74,-9,-19,-4,-7,-26,-30,-28,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-27,31,17,-27,-14,-2,-26,0,-16,-18,11,-13,1,-2,-3,-8,-23,-33,-16,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-8,-36,0,2,-29,-20,-15,-18,-8,-25,-17,-12,56,-3,-16,-7,-7,-25,-30,-24,-4;
MA   /M: SY='R'; M=7,-4,-22,-7,6,-21,-12,-7,-20,8,-14,-11,-1,-13,3,18,-1,-6,-14,-23,-15,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=1,-8,-24,-7,2,-22,-7,-16,-18,-4,-20,-14,-7,12,-6,-11,4,3,-13,-28,-20,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,3,-25,6,-9,-27,42,-13,-34,-13,-26,-19,4,-15,-12,-15,3,-13,-25,-23,-24,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=6,-10,-15,-9,0,-15,-15,-16,-2,-10,-11,-8,-7,-14,-7,-13,11,4,7,-32,-16,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-21,-17,-16,-13,-25,-23,8,-13,-5,-2,-21,4,-19,-15,-9,-4,16,-29,-16,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=1,11,-15,14,2,-23,-4,-10,-23,-8,-26,-20,10,-10,-3,-10,25,18,-13,-37,-18,-1;
MA   /M: SY='V'; M=18,-21,-10,-25,-21,-8,-18,-26,13,-16,1,1,-21,-21,-21,-19,-1,4,28,-26,-14,-21;
MA   /M: SY='E'; M=10,6,-23,10,33,-27,-12,-7,-24,2,-17,-17,-2,-4,8,-8,3,-7,-20,-27,-20,20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=10,-22,-10,-26,-24,-5,-23,-27,17,-17,4,4,-22,-24,-24,-19,-2,6,34,-28,-12,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-21,-31,-21,5,-27,-13,24,-22,35,36,-25,-25,-12,-17,-25,-10,12,-20,0,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-11,2,-29,4,20,-24,-19,45,-26,-1,-19,-7,3,-12,19,0,-5,-14,-27,-25,3,17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-34,-11,0,-24,-22,-20,-12,-11,-20,-14,-20,62,-11,-19,-10,-9,-18,-29,-25,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-29,-11,-2,-19,-21,-2,-26,26,-18,-9,-2,-21,7,63,-10,-9,-15,-21,-10,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-23,-20,-31,-23,57,-26,-4,-6,-25,2,-2,-13,-27,-30,-16,-12,-8,-5,0,23,-23;
MA   /M: SY='A'; M=18,-3,-17,-5,-6,-20,-10,-7,-13,-5,-12,-9,-6,-15,-8,-6,2,-4,-2,-25,-14,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-29,20,48,-29,-18,0,-30,10,-21,-20,2,-3,16,6,1,-9,-28,-30,-19,31;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-23,-19,-24,-15,-4,-30,-24,23,-19,12,8,-22,-22,-18,-19,-12,-3,26,-26,-8,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-12,-30,-14,-4,-18,-22,-4,-20,23,-15,-6,-2,-20,6,58,-11,-10,-14,-20,-9,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-23,-10,-3,-17,-19,0,-7,-2,-8,-3,0,-17,4,6,-4,-4,-7,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-14,12,-30,20,33,-32,-18,1,-30,14,-22,-17,4,-8,20,14,-2,-10,-28,-28,-16,25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,13,-31,-21,22,-30,45,19,-29,-29,-21,-21,-29,-10,11,-19,1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-17,-21,-20,-12,-2,-25,-12,9,-19,27,14,-15,-24,-5,-13,-18,-4,0,-22,-4,-9;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-8,-19,-6,5,-6,-18,10,-4,-7,3,3,-9,-14,-1,-6,-10,-8,-6,-15,4,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=2,-4,-20,-5,-5,-22,23,-9,-23,-4,-20,-11,0,-11,1,-6,3,-8,-18,-17,-17,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-8,12,-14,-14,-8,-17,-17,-2,-13,-6,-5,-6,-17,-14,-13,3,11,7,-26,-11,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-18,22,4,-21,-2,-5,-23,-2,-19,-16,8,-9,-2,-2,5,3,-16,-25,-14,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-10,14,-27,21,8,-29,2,1,-28,-6,-22,-17,5,-13,-1,-10,0,-7,-21,-31,-16,3;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-8,-28,-5,6,-25,4,-15,-23,-9,-20,-16,-7,16,-6,-14,0,-5,-22,-27,-23,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,36,-25,19,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-5,6,-12,-3,-10,-16,-5,-12,-16,-9,-15,-13,11,-17,-10,-7,8,17,-10,-31,-16,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-8,-22,-1,15,-29,-9,-14,-27,-6,-26,-20,-11,34,-3,-14,-5,-11,-28,-30,-27,4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,14,-26,20,37,-27,-16,3,-28,4,-22,-19,8,-5,12,-3,5,-2,-26,-33,-17,24;
MA   /M: SY='N'; M=-8,31,-18,13,-2,-18,-4,3,-18,-2,-26,-18,47,-18,-2,-2,12,11,-23,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-26,-15,-12,-19,10,-17,-9,-16,-7,-4,-9,-19,-6,-15,-5,-8,-8,-22,-16,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-25,-3,16,-19,-18,-2,-19,5,-15,-5,-2,-11,17,9,1,-3,-18,-23,-11,16;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-12,-24,-13,-8,-14,-23,21,-10,3,-7,3,-7,-22,-2,12,-12,-11,-4,-25,1,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-11,20,-21,36,38,-25,-25,-11,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-19,-26,-18,10,-26,-19,13,-27,37,13,-24,-27,-18,-19,-20,-6,7,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-1,-27,0,20,-32,-17,1,-23,14,-20,-7,-1,-9,32,12,-1,-9,-24,-22,-13,26;
MA   /M: SY='S'; M=1,13,-16,11,2,-22,-2,4,-23,-7,-29,-19,22,-13,1,-7,26,10,-18,-39,-17,1;
MA   /M: SY='S'; M=7,-8,-21,-10,-2,-23,-12,-12,-16,-2,-20,-12,-5,5,3,-1,9,4,-12,-27,-18,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-13,15,-29,24,25,-25,-11,1,-28,1,-21,-19,3,-10,8,-6,-2,-8,-26,-23,-6,16;
MA   /M: SY='N'; M=-2,9,-18,2,-2,-18,-6,-5,-21,-1,-27,-18,20,-15,0,2,18,10,-18,-27,-15,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=0,9,-16,9,10,-21,-9,-8,-21,-5,-24,-19,11,-9,1,-8,23,17,-15,-36,-18,5;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-23,-8,-4,-16,-16,-1,-14,9,-14,0,5,-19,6,27,-3,-5,-11,-26,-11,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,16,-36,-20,1,-24,27,-24,-4,0,-10,39,19,-4,-10,-26,-20,-10,27;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /GENERATED_BY="pfmake -2bm walinea202.1.msa /usr/molbio/share/pftools/blosum45.cmp";
//