ID   SEQUENCE_PROFILE; MATRIX.
AC   ZZ99999;
DT   Wed Jul 30 16:24:52 2003
DE   Generated from MSF file: 'walinea233.1.msa'.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
CC   Automatic scaling using shuffled database
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7030; R2=0.01403479; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=484; N_SCORE=8.5; MODE=1;
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=341; N_SCORE=6.5; MODE=1;
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=9,-8,-20,-7,-4,-24,2,-15,-21,-11,-27,-19,-2,17,-6,-15,18,5,-16,-32,-24,-6;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-10,-12,-12,-10,-19,-20,-5,-12,-10,-8,-3,-13,-12,-12,18,38,6,-31,-11,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-25,-14,2,-28,-15,14,-24,39,17,-25,-27,-8,-15,-25,-10,4,-20,-2,-11;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,32,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-10,24,-18,-17,-10,-24,-23,-11,-18,-4,-9,-10,-21,-17,-17,5,25,-1,-34,-14,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,17,53,-30,-20,-1,-30,15,-21,-19,0,-1,19,4,-1,-10,-29,-29,-19,36;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-28,-22,-20,26,-30,13,4,-14,9,4,-22,-30,-12,-12,-22,-10,-6,21,65,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-16,-19,-24,-22,-3,-23,-12,22,-15,10,28,-12,-23,-12,-15,-13,-6,19,-26,-6,-18;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,39,17,-30,-30,-23,-20,-24,-7,21,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-3,-11,-19,-10,-27,-19,9,-10,-1,-10,37,24,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='A'; M=18,-14,-14,-20,-12,-13,-15,-19,0,-12,1,-1,-14,-16,-7,-15,1,5,7,-23,-13,-10;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-10,-19,-12,-17,-4,-20,-6,-11,-9,-8,-11,-13,-12,-19,11,2,6,-24,-19,-12;
MA   /M: SY='V'; M=7,-18,8,-22,-21,-9,-21,-25,4,-17,-4,-3,-17,-23,-21,-19,3,8,20,-32,-15,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,14,-9,4,-33,-23,-5,-24,4,-22,-7,-6,-19,26,1,-4,-10,-23,-29,-16,15;
MA   /M: SY='E'; M=-12,8,-30,16,49,-28,-20,18,-30,6,-20,-16,2,-4,18,0,-2,-12,-30,-30,-13,33;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-14,-18,-12,-22,13,-20,-15,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-15,-15,-16,-13,-11,-19,-18,4,-3,-7,4,-12,-20,-11,-7,3,3,16,-30,-12,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-45,-40,-30,21,-22,-28,-17,-22,-15,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-25,128,30,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-34,-32,-34,-24,10,-26,-24,4,-26,21,4,-34,-30,-20,-20,-34,-18,-6,50,12,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,-26,-8,4,-20,-22,-8,-19,24,-17,-7,-5,-17,4,35,-9,-8,-8,-23,-11,2;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-29,-7,-8,-24,19,-7,-33,6,-25,-15,7,-20,-3,25,-4,-13,-25,-22,-19,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,19,-30,-20,17,-30,45,17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-20,-23,-14,2,-24,-16,8,-19,29,10,-20,-26,-13,-6,-17,-6,3,-23,-4,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-3,-22,-6,10,-26,-14,-5,-19,6,-16,-8,-3,-10,18,9,3,-1,-16,-22,-14,13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-30,19,29,-33,-5,-3,-32,10,-25,-18,4,-7,15,1,-1,-11,-29,-28,-19,22;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-20,-34,-24,35,-28,-17,12,-27,30,18,-25,-28,-25,-18,-25,-10,6,-8,12,-22;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-26,-9,-4,-23,30,-16,-26,-14,-14,-13,-5,-16,-11,-16,-3,-14,-20,-22,-23,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-7,-29,-10,-4,-16,-8,-15,-13,0,-17,-10,-3,-18,-6,-5,-10,-12,-12,1,-8,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-10,-7,-11,2,-9,-20,-3,-21,-4,-17,-12,-9,-2,-7,-9,-7,-10,-17,-24,-9,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-12,4,-28,12,5,-27,-19,-7,-15,-5,-13,-9,-5,3,8,-9,-6,-9,-15,-29,-16,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-23,10,28,-25,-15,-5,-25,10,-23,-17,8,-6,9,2,8,4,-22,-31,-17,19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=6,-8,-11,-10,-8,-8,5,-11,-6,-11,0,-3,-6,-11,-8,-11,0,-3,-4,-14,-10,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-30,-11,-4,-22,-19,-19,-10,-10,-20,-13,-19,61,-11,-17,-9,-7,-15,-26,-23,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-18,-30,-25,1,-31,-26,27,-24,20,13,-23,-24,-22,-21,-14,2,27,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-7,-21,-10,1,-17,-24,-15,-3,1,-9,-3,-8,-13,2,-4,0,8,1,-26,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-28,-27,-33,-25,8,-35,-18,32,-26,25,16,-23,-25,-18,-23,-23,-10,17,-11,15,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-9,-26,-14,-12,10,-23,19,-9,-9,-2,-1,-2,-25,-8,2,-14,-10,-13,-8,23,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-7,55,-8,9,-24,-26,-17,-30,-13,-20,-20,-11,-23,-8,-17,-6,-10,-19,-41,-26,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-6,-28,-6,11,-30,-22,4,-15,7,-9,2,-5,-14,41,14,-6,-10,-22,-20,-8,25;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-13,-1,-3,-21,10,-11,-23,-11,-30,-20,9,-11,-3,-11,34,14,-13,-37,-21,-3;
MA   /M: SY='C'; M=11,-11,41,-21,-18,-17,-18,-24,-18,-18,-14,-14,-11,-22,-18,-21,5,12,-4,-35,-21,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29,0,-37,-26,46,-27,20,25,-20,-20,-17,-27,-20,-10,27,-20,0,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /GENERATED_BY="pfmake -2bm walinea233.1.msa /usr/molbio/share/pftools/blosum45.cmp";
//